Un equipo de investigadores liderado por la Dra. Janine Altmüller del Max Delbrück Center, el BIH y el Hospital Universitario de Colonia ha utilizado la tecnología de secuenciación de lectura larga para estudiar, en detalle, el síndrome de Bartter tipo 3, una enfermedad hereditaria que afecta a los riñones debido a la ausencia del gen CLCNKB. Esta enfermedad causa desequilibrios en los electrolitos y dificulta la reabsorción de nutrientes y sales durante la filtración y la producción de orina en los riñones.
El Dr. Bodo Beck, genetista humano, encontró un caso inusual de esta enfermedad en tres niños de una familia que había huido de Siria. Aunque el diagnóstico genético confirmó la enfermedad, lo sorprendente fue la gravedad de los cambios en las articulaciones de estos pacientes, algo poco común en el síndrome de Bartter tipo 3. Para investigar esta variante inusual, el Dr. Beck se asoció con la Dra. Janine Altmüller y su equipo, expertos en secuenciación de lectura larga.
La secuenciación de lectura larga es esencial para analizar estructuras genómicas complejas. A diferencia de la secuenciación de lectura corta, que corta el ADN en pequeños fragmentos, la secuenciación de lectura larga permite secuenciar tramos más largos de ADN en una sola ejecución, lo que facilita la comprensión de las secuencias de ADN repetidas en el síndrome de Bartter tipo 3, que no se habían explorado previamente debido a las limitaciones de la tecnología de lectura corta.
El equipo de la Dra. Altmüller identificó varias variantes genéticas, previamente desconocidas, en genes CLCNKB y CLCNKA en pacientes con esta enfermedad. También encontró un patrón genético que parece favorecer la aparición de variantes causantes de la enfermedad. A pesar de estos avances, no se encontraron secuencias eliminadas adicionales en la familia siria, por lo que el síndrome de Bartter tipo 3 siguió siendo el único diagnóstico.
Estos hallazgos proporcionarán a los científicos una comprensión más profunda de las causas de la enfermedad, lo que podría facilitar el desarrollo de mejores opciones de diagnóstico y tratamiento. La Dra. Altmüller ya ha dado el primer paso hacia el uso de esta tecnología en la práctica clínica: Pronto comenzará un estudio piloto en colaboración con socios de Berlín, Hannover, Tübingen y Aquisgrán en el que aplicaremos la secuenciación de lectura larga a una cohorte más amplia de pacientes con enfermedades genéticas raras no resueltas.
Más información en: https://www.news-medical.net/news/20230823/Long-read-sequencing-reveals-new-details-of-Bartter-syndrome-type-3.aspx
